清洗一般按下列程序进行。灭藻清洗、碱洗、封存、(中)钝化、碱洗后水冲洗、运行、(中和)预膜、酸洗、漂洗、酸洗后水冲洗、水冲洗(检漏)
1、水冲洗(检漏)
水冲洗的目的是大流量的水尽可能冲洗掉系统中的灰尘、泥砂、脱落的藻类及腐蚀产物等一些疏松的污垢，同时检查临时系统的泄漏情况。
2、灭藻清洗
灭藻清洗的目的是杀死系统内的微生物，并使设备表面附着的生物枯泥剥离脱落。
3.碱洗
碱洗的目的是除去系统内的汕污，以保证酸洗均匀(一般当系统内有油污时才需要进行碱洗，新建设务一般需要)。
4、碱洗后的水冲洗
碱洗后的水冲洗是为除去系统内残留的碱洗液。并使部分杂质被带走。在冲洗过程中，需测试排除口冲洗液的pH值和浊度.
5、酸洗
酸洗的目的是利用酸液与水垢和金属氧化物进行化学反应，生成可溶性物质而除去。为抑制和减缓酸洗液对金属的腐蚀，在酸洗液中常需添加适当的缓蚀剂。并在点放空和底部排污.以避免产生气阻和导淋堵塞，t响清洗效果。
6、酸洗后的水冲洗
此次水冲洗是为了除去残留的酸洗液和系统内脱落和固体颖粒，以便漂洗和钝化处理(或预膜)。冲洗过程中.应每隔10min测定一次排出的冲洗液的pH值，当接近中性时停止冲洗。
7.漂洗
漂洗的目的是利用低浓度的酸洗液清洗系统内在水冲洗过程中形成的浮锈，使系统总铁离了浓度降低，以保证钝化效果。
8、中和钝化(或预膜)
使用季结束后清洗：
中央空调应对季节性停机时，建议做好清洗工作。清洗中央空调过滤网时，将过滤网抽出来，用吸尘器把上面的尘土吸干净，也可以用清水冲洗干净。晾干后装入空调使用。对尘土较多的环境，过滤网应该经常清洗，以免灰尘太多堵死出风口，而影响制冷效果。清洗好后只开空调器的风机，运转约2至3小时，使空调器内部干燥，祛除湿气。
冷水机故障维修，水冷式冷凝器的冷却水由于是开放式的循环回路，一般采用的自来水经过冷却塔循环使用。当水中的钙盐和镁盐含量较大时，极易分解和沉积在冷却水管上而形成水垢，影响传播。结垢过厚还会使冷却水的流通截面缩小，水量减少，冷凝压力上升。因此，当使用的冷却水的水质较差时，对冷却水管每年至少清洗一次，冷水机故障维修，去除管中的水垢极其污物。
为了防止水垢的形成，抑制微生物的生长繁殖，控制设备及管道的腐蚀，提高热交换效率，节约能源，延长设备的使用寿命，有必要对中央空调循环水的水质进行处理。目前普遍采用的电子除垢仪，从这几年接触的用户来看，其阻垢防腐效果极差，而添加水质稳定剂的化学处理则效果明显。